科孊出版物の問題を解決する方法は

で、この蚘事の最初の郚分、我々は研究を行い、デヌタが難しい普及科孊出版システムの問題を芋たした。このトピックが興味深いものであり、倚くの興味深いアむデアやコメントを集めたこずを非垞にうれしく思いたす。



今回は、どの゜リュヌションがすでに発明、実装、開発されおいるかに぀いお説明したす。最埌に、科孊情報の亀換に最適なシステムのビゞョンに぀いお説明したす。







科孊情報怜玢システム 



オンラむンで科孊蚘事を芋぀けるこずができるようになったずいう事実は、もはや驚くべきこずではありたせん。しかし、ほんの数十幎前、物事は決しお容易ではありたせんでした。



人生からのいく぀かの物語
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これで、芁玄から、著者、タむトル、発行幎、たたはキヌワヌドごずに蚘事を芋぀けるこずができたす。あなたがしなければならないのは、Scopus、PubMed、GoogleScholarたたは他のシステムを開くこずだけです。



しかし、間違いなく改善の䜙地がありたす。ほずんどのシステムは泚釈のみで怜玢したすが、テキスト党䜓を怜玢するず、はるかに倧量の情報にアクセスできたす。これは、倚くの堎合、党文が公開されおいないずいう問題を匕き起こしたすペむりォヌルのため。さらに、䜜業や個々の実隓で䜿甚された方法による怜玢機胜が圹立぀でしょう。



怜玢゚ンゞンの䜿甚は、新しいゞャヌナルたたはプレプリントアヌカむブを䜜成する際の重芁な芁玠です。倚くの堎合、人気のある怜玢サヌビスは、特定の分野の倚くの科孊者によっお䜿甚されおいたすたずえば、生物孊や医孊では、PubMedです。この堎合、そのような怜玢゚ンゞンによっお玢匕付けされおいないリ゜ヌスで公開された蚘事は、科孊界には事実䞊芋えないこずがわかりたす。



オヌプンアクセス 



珟代の科孊雑誌の最も重芁な問題の1぀は、賌読による蚘事ぞのアクセスの制限ですペむりォヌル。少なくずも䞀床蚘事を扱ったこずがある人は誰でもこれに出くわしたした。



前のシリヌズの芁玄
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蚘事ぞのアクセスの問題は䞀般的に認識されおおり、科孊界はすべおの蚘事をオヌプンアクセスに倉換するために倚倧な努力を払っおいたす。



この問題の解決策は叀くから知られおいたす。出版のために蚘事を提出するずき、著者は1回限りの料金を支払い、蚘事は自由に配垃されたす。誰でも自由に蚘事をダりンロヌドできたす。公開コストは別の議論のトピックですが、珟圚の䟡栌であっおも、パブリックドメむンですべおの蚘事を公開するず、すべおの倧孊のサブスクリプションよりもコストが䜎くなりたす。



最も興味深いのは、それが雑誌にずっおも有益であるずいうこずです-圌らは賌読システムを維持する必芁はなく、単に著者からお金を受け取るだけです。



PeerJ
rg_software. PeerJ , open access ( 1200$). — 400$ ( ) — .


さらに、パブリックドメむンの蚘事には、より倚くの読者がいる可胜性がありたすそのような蚘事ぞのアクセスは䜕にも制限されおいないため。぀たり、匕甚を取埗しやすくなりたす。繰り返しになりたすが、これは圱響芁因を高めるため、著者だけでなく雑誌も含め、すべおの人にずっお有益です。



事前提出



倚くの雑誌には、テキスト、むラスト、および蚘事の他の郚分のフォヌマットに関する独自の基準がありたす。これは非垞に厄介な問題に぀ながる可胜性がありたす。誰もがこの問題に盎面しおいるわけではありたせんが、運が悪ければ、研究自䜓を改善するこずなく、完党に非生産的な䜜業を行っお埅぀のに6か月を無駄にする可胜性がありたす。前の雑誌で線集者が蚘事を拒吊した堎合、雑誌のデザむンを完党にやり盎す必芁があるず話しおいる。倚くの堎合、倉曎は重芁で時間がかかる可胜性がありたす。たた、蚘事は耇数回拒吊される可胜性がありたす。



しかし生物孊では...
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蚘事党䜓を完党に曞き盎すこずを避けるために、ゞャヌナルは著者に事前提出を提䟛したす。著者は、蚘事の簡単な説明を線集者に送信するだけです。線集者は予備的な決定を䞋したす。蚘事が雑誌に合わない堎合は、デザむン党䜓の準備に時間を無駄にするこずなく、別の雑誌に送るこずができたす。線集者があなたの仕事に興味を持っおいる堎合は、レビュヌのための党文の通垞の提出が始たりたす。珟圚、倚くの出版瀟が著者にこの機䌚を提䟛しおいたす。



事前提出は小さな改善のように思えるかもしれたせんが、ゞャヌナルの数が非垞に倚い今日の状況では、䜜成者の䜜業が楜になり、倚くの時間を節玄できたす。 



研究の事前登録事前登録



かなり興味深いパむロットプロゞェクトがPLoS出版瀟によっお立ち䞊げられたした。䜜業の最初に、プロゞェクトをゞャヌナルに登録できたす。この堎合、登録時に最終結果や既補のテキストがないずいう抂念に぀いおのみ話したす。この事前登録は、他の孊者や朜圚的な査読者から早い段階でフィヌドバックを埗る興味深い機䌚です。このアプロヌチは、䜜業を最適化し、ゞャヌナルに送信するずきにすでにレビュヌをスピヌドアップするのに圹立ちたす。



事前登録のもう1぀の利点は、蚘茉された仮説を確認できたかどうかに関係なく、結果の公開です。事実、珟圚、吊定的な結果を公衚するこずはほずんど䞍可胜です。これは、科孊的事実の認識に偏りをもたらしたす。確認された仮説のみが公開され、倱敗した仮説は非垞にたれに公開されたす。事前登録するこずでこの問題を解決できたす。プロゞェクトを最初から登録しおいる堎合は、ポゞティブかネガティブかに関係なく、最終結果が公開されたす。



プロゞェクトの事前登録には明らかな欠点がありたす。䞀郚の孊者は、このようにしお興味深いトピックを「占有」し、ゆっくりず探玢するこずが可胜になるず信じおいたす。党䜓ずしお、そのようなシステムにおける優先順䜍の問題は非垞に物議を醞すようになりたす。科孊の倚くの分野では、実隓的な怜蚌ほど重芁なのは最初のアむデアではありたせん。぀たり、プロゞェクトを提案するのは簡単ですが、実装するのははるかに困難です。事前登録により、グルヌプが調査できるよりも倚くのプロゞェクトを提出するこずができたす。



しかし、このシステムにはさらに明らかな欠点もありたす。事前登録を䜿甚する雑誌は、埓来の雑誌に比べお䞍利です。結局のずころ、事前登録では、プロゞェクトの詳现を開く必芁がありたす。たた、最初から、研究を公開するゞャヌナルを遞択する必芁がありたす。他の孊者はあなたのプロゞェクトのアむデアを䜿甚しお、圌らの研究を䌝統的なゞャヌナルに発衚するこずができたす。぀たり、事前登録システムは、すべおのゞャヌナルが参加しおいる堎合にのみ効果的に機胜したす。



蚘事のレビュヌ



前のシリヌズの芁玄
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レビュヌは公開プロセスの最も重芁な郚分です。レビュヌがないず、情報が怜蚌されたこずを確認できたせん。ただし、これは長くお骚の折れるプロセスです。レビュヌを最適化するいく぀かの方法がありたす。





プレプリント



プレプリントは、レビュヌアによっおただレビュヌされおいない、䜜成された科孊テキストです。著者は、arxiv.orgやbiorxiv.orgなどの専甚サむトに研究を投皿できたす。



プレプリントサヌビスは最近非垞に人気がありたす。科孊的情報の普及ずいう点では、通垞の蚘事に劣るこずはありたせん。誰でも原皿をダりンロヌドしお読むこずができたす。䞻な違いは、プレプリントが怜蚌されおいないこずです。しかし、専門家がそれを読んだ堎合、この問題はそれほど重芁ではありたせん-読者は自分自身のレビュヌアずしお機胜したす。しかし、プレプリントははるかに早く投皿できるため、情報亀換がスピヌドアップしたす。



ほずんどの堎合、プレプリントは同時に通垞の科孊ゞャヌナルに送信されたす。぀たり、しばらくするず、プレプリントは通垞のピアレビュヌ蚘事になりたす。堎合によっおは、プレプリントはクロヌズドアクセスの問題を解決するのに圹立぀だけでなく、蚘事がただ改蚂されおいる間に同僚からコメントを埗るこずができたす。



しかし、物理孊では...
Jerf :

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F1000Research



F1000Research マガゞンは、䞡方の可胜性を組み合わせたした。原皿は最初にプレプリントずしお公開され、レビュヌ埌に怜蚌枈みの蚘事のステヌタスを受け取りたす。私の意芋では、これは有望な方向性ですが、これたでのずころ、これを䜿甚しおいる雑誌はほずんどありたせん。



この雑誌では、土井を割り圓おたポスタヌやスラむドを公開するこずもできたす。぀たり、これらの資料を怜玢し、必芁に応じお匕甚するこずが容易になりたす。



私は圌らのホヌムペヌゞに瀺されおいるこの雑誌の䜍眮に非垞に近いです

nullの結果、デヌタメモなどを含むすべおの調査結果を公開したす。

レビュヌアずオヌプンか぀透過的に関䞎したす。

研究の圱響を加速したす。


興味深いこずに、同様のモデルのために遞択したJMIRx - biorxiv、medrxivずpsiarxivに関連付けられた雑誌。著者は蚘事をアヌカむブにアップロヌドし、JMIRx線集者はいく぀かの蚘事を遞択しおレビュヌのために送信したす。著者自身が蚘事の改蚂を申請するこずができたす。レビュヌアによっお提案された線集もアヌカむブにアップロヌドされたす。



JMIRxでのアむデアの説明は次のずおりです。

研究者は、タむプ1の電子論文[ピアレビュヌされおいないプレプリント]をプレプリントサヌバヌに提出しお、ディスカッションずピアレビュヌを行うこずができたす。ゞャヌナルの線集者ず発行者は、「タむプ2の論文」ずしお芋たい最高の論文を遞んで入札したす[圌らのゞャヌナルのレコヌドのバヌゞョン]。


私の意芋では、これは結果を公開するための新しいアプロヌチの玠晎らしい䟋です。私は圌らの決定のすべおに同意するわけではありたせん。たずえば、レビュヌアは䞻に蚘事の著者の提案に埓っお招埅されたすが、むノベヌションを導入する原則は非垞に正しいず思いたす。



ゞャヌナルに提出する前のピアレビュヌ



最近、科孊者が蚘事を特定のゞャヌナルではなく、すべおの䞀般的なレビュヌに提出するように、いく぀かのゞャヌナルが統合されたした。レビュヌに合栌するず、発行に最適なゞャヌナルが遞択されたす。線集者もこのプロセスに参加し、この堎合は組合党䜓を代衚したす。



このレビュヌ圢匏により、蚘事がプロセスの特定のゞャヌナルによっお拒吊されないずいう確信が埗られたす。これは、発行する特定のゞャヌナルの遞択がレビュヌ埌に行われるため、䜜成者が再送信に時間を浪費しないこずを意味したす。



そのようなスキヌムの明らかな発展は、たすたす倚くのゞャヌナルの統合になるでしょう。ただし、発行者間の競争がこのプロセスの障害になる可胜性がありたす。ある出版瀟の枠組みの䞭で、そのトピックに関する適切な雑誌を芋぀けるこずはそれほど難しくありたせん。さらに、さたざたな発行元が同様のトピックの雑誌を持っおおり、圱響芁因の点で近いこずがよくありたす。



レビュヌの公開



䞀郚のゞャヌナルeLifeやNatureなどはピアレビュヌを公開しおいたす。レビュヌは科孊的プロセスの重芁な郚分であるため、これは正しいず思いたす。レビュヌアが良い実隓を提案し、重芁な䞍正確さに気づいた堎合、圌は研究の発展に貢献したした。䞀方、レビュヌ担圓者の芁件が完党に非論理的である堎合もありたす。その堎合、远加された内容ず䜜成者が最初に提案した内容を理解するためにレビュヌを確認するこずも圹立ちたす。同時に、レビュヌの公開は、レビュヌアが匿名のたたであるこずを劚げるものではありたせん。



匿名のレビュヌの必芁性の質問には明確な答えがありたせん。ほずんどの堎合、著者の名前がわかっおいお、レビュヌ担圓者が匿名である堎合は、セミブラむンド方匏が䜿甚されたす。Natureでは、著者もレビュヌアも名前を開瀺しない堎合に、二重ブラむンドレビュヌの倉圢が提案されたしたレビュヌ埌、もちろん著者の名前が開かれたす。同時に、蚘事の匿名性を確保する䜜業は著者に委ねられおおり、これは決しお簡単なこずではありたせん。倚くの堎合、トピック、目的、および䜜業方法によっお、研究を行った研究所を正確に特定するこずが可胜です。



レビュヌアの匿名化
CactusKnight , :



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それどころか、すでに述べたF1000Researchは、反察のアプロヌチをサポヌトしおいたす。レビュヌは完党にオヌプンです。著者ず査読者の䞡方がお互いの名前を知っおいたす。どちらのアプロヌチが良いか明確な意芋はありたせん。それぞれに独自の利点がありたす。ある点で、議論の倚くの参加者は、匿名のレビュヌがおそらくより重芁であるこずに同意したす。



レビュヌアの報酬



私の意芋では、明らかな問題の1぀は、レビュヌ担圓者の䜜業が支払われないこずです。





雑誌がそのようなシステムを倉えるこずに党く興味がないこずは明らかです。しかし、それにもかかわらず、小さな進歩が起こっおいたす。䞀郚のゞャヌナルは、少なくずもアクティブなレビュヌアのための無料出版の可胜性に぀いお議論しおいたす。この方向ぞのステップは非垞に小さいですが、コミュニティは既存のモデルの欠陥に぀いお真剣に反省し始めおいるようです。



涌しさの尺床ずしおの圱響係数



珟代の科孊的プロセス党䜓の非垞に重芁な問題は、科孊的研究の成功ず有効性をどのように評䟡するかです。これはあらゆる偎面から議論できる氞遠のトピックですが、今日、科孊出版物がこれにどのように圱響するかが重芁です。



重芁なのは、蚘事が科孊者の成功の䞻な尺床であるずいうこずです。成功指暙の倧郚分は、出版物に関連する1぀たたは別の指暙を䜿甚しおいたす。科孊に少しでも関わった人は誰でも、ヒルシュ指数、匕甚数、圱響芁因に぀いお聞いた。埌者は、助成金に぀いお報告するずきや新しい助成金を受け取るずきに最もよく䜿甚されたす぀たり、科孊者がどれだけのお金を持っおいるかを決定したす。これは、圱響芁因が研究者の成功に最も明確に圱響するこずを意味したす。



圱響芁因は深刻なビゞネスです




Impact Factorは、過去2幎間に発衚されたすべおの蚘事の1幎間の匕甚の合蚈です。぀たり、ゞャヌナル内の蚘事の匕甚の平均的な尺床です。したがっお、このパラメヌタの最も重芁な欠点は次のずおりです。圱響係数はゞャヌナルの特性であり、個別の蚘事の特性ではありたせん。ある皋床、これらの倀は盞関しおいたす-悪い蚘事は著名なゞャヌナルに公開されたせん。問題は、これが非垞に間接的な芋積もりであるずいうこずです。著者がどのゞャヌナルに蚘事を送信したかはわかりたせん。たた、線集者が蚘事を承認たたは拒吊したずきに䜕に導かれたかもわかりたせん。それは、蚘事の品質たたは新芏性、あるいは誇倧広告のトピックたたは著者の有名な科孊者のいずれかである可胜性がありたす。蚘事が良いゞャヌナルに掲茉された理由はわかりたせん。これは、蚘事のすべおの長所ず短所を組み合わせた环積的な指暙です。その䞊、最終的な決定は線集者の1人だけが行い、科孊論文の品質の評䟡は圌の決定に䟝存したす。これらすべおが圱響芁因を非垞に䞍透明にし、個々の蚘事の品質の枬定を分析するこずを困難にしたす。



科孊的研究の質の問題は非垞に耇雑です。より重芁な、高品質の実隓たたは新芏性は䜕ですかそれずも、トピックの瞬間的な人気ですかただし、圱響係数は、2幎間のすべおの項目に぀いお蚈算された、これらすべおのパラメヌタヌおよび他の倚くのパラメヌタヌを1぀の図に隠したす。 



圱響係数が圹に立たない堎合はどうなりたすか




倚くの科孊者は、圱響芁因の䜿甚に反察しおいたす。たずえば、圱響芁因の廃止を提唱するDORAずASAPbioの組み合わせです。eLife誌の創蚭者の1人であるノヌベル賞受賞者のRandySheckmanも、そのような指暙を攟棄するよう求めおいたす。興味深いこずに、eLifeは圓初、この評䟡で雑誌のむンデックスを䜜成するこずを望んでいたせんでした。しかし、圱響芁因のリストの線集者であるトム゜ン・ロむタヌは、圌らの意芋を考慮に入れおいたせんでした。





ただし、最も重芁なのは、倧芏暡なドナヌが䜿甚する評䟡原則です。圌らが別の評䟡方法を支持しお圱響芁因を攟棄するこずを決定した堎合、これは珟状を非垞に迅速に倉える可胜性がありたす。



再珟性



これは、珟圚科孊界党䜓が盎面しおいる最も重芁な問題です。この問題に察する単䞀の解決策はありたせん。ドナヌ、ゞャヌナル、科孊者自身が協力しおデヌタの信頌性を向䞊させる必芁がありたす。ただし、科孊出版物はこのプロセスで重芁な圹割を果たしたす。調査方法ずデヌタの可甚性を怜蚌するための蚘事のより厳密なピアレビュヌは、再珟性を向䞊させるための決定的な出発点ずなるはずです。





メ゜ッド、資料、およびデヌタの説明を敎理する1぀の方法は、さたざたな暙準圢匏を䜿甚するこずです。珟圚、方法を説明するための単䞀の基準はありたせんが、䞀郚の雑誌は独自の蚭蚈ガむドラむンを提䟛しおいたす。たずえば、Cell pressは、いわゆるSTARメ゜ッドずキヌリ゜ヌステヌブルを䜿甚したす。これは、方法を説明し、䜿甚されるすべおの材料を正確に指定するための基準のリストです。これらの基準は理想的ではありたせんが、倧きな前進です。たた、Cellではメ゜ッドをSupplementaryに転送できなくなりたした。これは、説明の暙準化にも圹立ちたす。



研究プロトコルたずえば、protocols.ioの亀換専甚の倚数のリ゜ヌスの出珟にも泚目する䟡倀がありたす。このために、特別な雑誌は非垞に詳现な手順で䜜られおいたす。そしお䟋えば雑誌JoVEJournal of Visualized Experimentsは、手順のテキストによる説明だけでなく、プロセスの詳现を瀺すビデオも公開しおいたす。これは、耇雑な実隓を再珟するのに非垞に圹立ちたす。



すべおの問題を解決する方法
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再珟性に関しおは、もちろんリトラクションりォッチに぀いお蚀及する必芁がありたす。これは、反察偎から問題を解決する詊みです。圌らは、すでに公開されおいる蚘事で、画像の倉曎、実隓的な䞍芏則性、その他の改ざんを探したす。最も泚意深く責任のあるレビュヌアでさえ、間違いや䞍正確さを芋逃す可胜性があるこずを理解するこずが重芁です。これは、コミュニティが疑わしい蚘事にフラグを立おるこずによっお支揎する堎所です。



倚くの堎合、リトラクションりォッチのアクションの結果ずしお、雑誌は改ざんされた蚘事を思い出したす。ここで、珟代のシステムの次のステップはほずんど実行されないこずに泚意しおください。たずえば、同じレビュヌアがチェックした他の蚘事をレビュヌする人は誰もいたせん。あるゞャヌナルの線集者が䜓系的に悪意のある査読者を芋぀けたずしおも、他のゞャヌナルはそれを知りたせん。



科孊者の盞互䜜甚



前回は、科孊蚘事にコメントする機䌚があり、掻発な反応がありたした。以前は、特別なゞャンルの出版物が広たっおいた-「蚘事ぞの解説」。぀たり、ある科孊者がゞャヌナルに小さなメモを曞き、そこで他の著者の蚘事に぀いお話し合ったのです。これは孊術的な議論の良い機䌚ですが、かなり遅いです。



今、私はそのようなメモにほずんど出くわしたせん。雑誌サむトにコメントのあるコヌナヌがありたすが、ほずんど誰も䜿っおいたせん。ここでのコメントは、蚘事のアむデアを発展させる远加情報の貎重な情報源ずしお圹立぀ため、私はこの点でHabrに非垞に刺激を受けおいたす。科孊雑誌のコメントは異なった働きをするはずですが、小さな実隓的な蚘事や議論を発衚する可胜性が非垞に求められおいたす。



ゞャヌナルコメントの珟圚の仕組み
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www.nature.com/articles/nature14295, Nature, , , . , , , , . . , , , . 



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この蚘事の読者のほずんどは同じ分野の専門家であるこずに留意する必芁がありたす。それらの倚くは、蚘事のデヌタたたは実隓的アプロヌチを䜿甚したいず考えおいたす。぀たり、圌らの意芋は、蚘事の䜜成者ず他の読者の䞡方にずっお䟡倀がありたす。そしお科孊者たちは珟圚、そのようなコミュニケヌションを促進するためにさたざたなツヌルを䜿甚しおいたす。



これには重芁な理由がありたす。
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驚いたこずに、Twitterは䟝然ずしお最も人気のあるプラットフォヌムの1぀です。科孊者は自分の蚘事ぞのリンクを共有するだけでなく、非垞に倧芏暡な議論を手配したす。これは少なくずも文字数の制限のためにあたり䟿利ではないように思えたすが、プラットフォヌムはすでに科孊者にずっお䞀皮の゜ヌシャルネットワヌクになっおいたす。



しかし、より専門的なプラットフォヌムも進化しおいたす。おそらく科孊者にずっお最も有名な゜ヌシャルネットワヌクはResearchGateです。これは、幅広い機胜を備えたかなりナヌザヌフレンドリヌなサむトです。ここでは、蚘事やプレプリントをアップロヌドしたり、興味のある科孊者の最新情報を賌読したり、ただ公開されおいない実隓でWIPプロゞェクトを䜜成したり、蚘事にコメントを曞き蟌んだりできたす。出版物、質問、回答、および加入者数で構成される評䟡システムもありたす。



Elsevierは、Mendeleyの曞誌プログラムに基づいた孊者のための独自の゜ヌシャルネットワヌクを持っおいたす。驚いたこずに、Elsevierを賌入した埌でも、プログラムは無料のたたです。これはかなり䟿利なリファレンスマネヌゞャヌですが、゜ヌシャルネットワヌクずしおは䜿甚したせんでした。



未来の雑誌の芋方



実際、このセクションのタむトルで私はあなたをだたしたした。この抂念に぀いお特に未来的なこずは䜕もありたせん。科孊者をロボットに眮き換えおデヌタを自動的に収集したり、ブロックチェヌンを䜿甚しお改ざんから保護したりするこずはお勧めしたせん。私が䜿甚するこずを提案するすべおのものはすでにそこにあり、䜿甚されおいたす。私は、䞀緒に機胜する抂念を組み合わせるこずを提案しおいるだけです。



本旚 



アむデアは、著者が任意のトピックに関する研究をアップロヌドできる情報の単䞀のアヌカむブを䜜成するこずです。同時に、科孊ゞャヌナルの利点を兌ね備えおいたすが、ほが自動的に機胜したす



システムはJANEなどのプログラムに基づいおいたす。そのようなプログラムに粟通しおおらず、生物医孊のトピックに関する短い科孊的テキストが手元にある堎合は、リンクをたどっお詊しおみるこずをお勧めしたす。JANEは同様の蚘事を怜玢し、これに基づいお適切なゞャヌナルを遞択し、このトピックに取り組んでいる著者をリストしたす。詳现に぀いおは、この蚘事で説明しおいたす。



ゞェヌンは誰ですか
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そのようなプログラムは自動線集者の圹割に理想的であるように私には思えたす。圌女は䞻題のカテゎリヌずキヌワヌドをチェックするだけでなく、レビュアヌを芋぀けるこずができたす。



蚘事の䜜成者が原皿をサヌバヌにアップロヌドし、プログラムが適切なレビュヌ担圓者を芋぀けおメヌルを送信したす。レビュヌアは蚘事をチェックし、決定を䞋し、サむト䞊の蚘事のステヌタスをマヌクし、必芁なコメントを䜜成者に送信したす。修正の結果に基づいお、レビュヌ担圓者は蚘事の公開を承認し、評䟡を付けたす。



したがっお、プレプリントアヌカむブの䟡栌でピアレビュヌゞャヌナルを入手できたす



これらは私が提䟛したいすべおの機胜ではありたせんが、これは最も基本的な考え方です。必芁な機胜を远加するのは簡単です。そのようなサヌビスがどのように芋えるかを詳しく芋おみたしょう。



詳现



フォヌマットノヌト



サヌビスはすべおの人が利甚できる必芁があり、すべおのドキュメントは公開されおいる必芁がありたす。



先ほどお話したF1000Researchマガゞンのコンセプトがずおも気に入っおいたす。したがっお、ロヌド埌すぐに、テキストはプレプリントずしお䜿甚できるようになりたす。同時に、レビュヌがただ合栌しおいないこずが明確に瀺されおいたす。レビュヌ埌、蚘事のステヌタスはレビュヌ枈みの蚘事に倉わりたす。



通垞、蚘事はいく぀かのセクションで構成され、倚くの堎合、さたざたな仮説、実隓、たたは䜜業の䞀郚を衚したす。そのようなセクションや個々の実隓にキヌワヌドを远加しお、それらを芋぀けやすくするこずが圹立぀ず思いたす。この実隓を実斜および分析した著者に぀いおも蚀及する䟡倀がありたす。



実隓ごずに、䜿甚された方法が参照されたす。これらの方法は、完党なプロトコルを参照しお説明されおいたす。このようなプロトコルは、特別なサむトprotocols.ioなどで個別に公開できたす。



すべおのデヌタは、必然的に独立したサヌビスに配眮されたす。リンクは、各実隓を特定の結果ファむルにリンクしたす。



制埡ず再珟性を高めるために、プロゞェクトの電子ラボゞャヌナルぞのアクセスを開くための芁件を远加できたすこのようなゞャヌナルの䟋はベンチリングです。今ではこれは䜕の努力も必芁ずしたせんが、改ざんを倧幅に枛らし、実隓の説明を改善するこずができたす。ただし、電子実隓宀ゞャヌナルはただ暙準になっおいないため、珟時点では芁件が厳しすぎる可胜性がありたす。さたざたなタむプの



他の蚘事ぞのリンクを提䟛したす。぀たり、蚘事の匕甚だけでなく、参照ずしお瀺される匕甚もあれば、研究の基瀎ずしお瀺される匕甚もあれば、矛盟を瀺すために匕甚される匕甚もありたす。匕甚の皮類が異なれば、匕甚された蚘事の評䟡ぞの貢献も異なりたす。メンションずメむンリンクは自動的に決定できたす蚘事内の匕甚数によっお。この蚘事では、さたざたなタむプのリンクぞの興味深いアプロヌチに぀いお説明したす。これに぀いおは、以䞋で詳しく説明したす。



蚘事の特定のセクションの匕甚を 远加したす少なくずも内郚リンクの堎合。぀たり、別の蚘事を匕甚するずきは、この蚘事のどのセクションに必芁な情報があるかを瀺したす。これにより、蚘事内の事実の怜玢ず文献゜ヌスの怜蚌が倧幅に簡玠化されたす。



登録



誰でも蚘事やコメントを読むこずができたす。ただし、蚘事をアップロヌドしたり、コメントやレビュヌを曞き蟌んだりできるのは、登録ナヌザヌのみです。



登録するには、ピアレビュヌされたゞャヌナルの蚘事の著者であるか、出版物のある科孊者からの掚薊を受ける必芁がありたす。このようなシステムは、出版の可胜性に぀いお専門家の䞀定の保蚌ずしお機胜したす。



各参加者には評䟡が割り圓おられたす。登録時に、評䟡は曞誌的指暙蚘事数、匕甚数、ヒルシュ指数に基づいお決定されたす。



自動゚ディタヌずレビュヌ



著者が蚘事をサヌバヌにアップロヌドするず、システムは芁玄を分析し、キヌワヌドずレビュヌ担圓者を遞択したす。レビュヌアを遞択する際には、利害の衝突を避けるために、共著者ず所属が考慮されたす。



レビュヌアはさたざたな評䟡で遞択されたすが、䜎すぎないようにしたす。぀たり、システムは、評䟡が高く平均的なレビュヌアを芋぀けようずしたす。レビュヌアの怜玢は、登録ナヌザヌだけでなく、デヌタベヌスに出版物を持っおいるすべおの科孊者の間で実行されたす。



遞ばれたレビュアヌは、ゞャヌナルから原皿のレビュヌを勧めるメヌルを受け取りたす。この手玙には、芁玄、党文ぞのリンク、および著者ずの匿名のコミュニケヌションチャネルぞのリンクが含たれおいたす。レビュヌアが提案を受け入れるず、蚘事を読み、レビュヌを著者に曞き蟌みたす。それが拒吊した堎合、システムはさらに調べたす。



この堎合の査読者の仕事は、いく぀かの指暙による原皿の評䟡のみが異なりたす。残りの郚分に぀いおは、レビュヌアは蚘事の長所ず短所に぀いおも説明し、远加の実隓を提案したす。レビュヌアのフィヌドバックはすぐに䜜成者に提䟛され、䜜成者は蚘事を修正しお远加の実隓を行うこずができたす。この堎合、すべおのレビュヌアからの応答を埅぀必芁はありたせん。䜜成者はすぐに応答を受け取りたす。



すべおの登録ナヌザヌは、「カスタム」レビュヌを䜜成しお蚘事を評䟡できたす。この評䟡は、遞択したレビュヌアの評䟡ずは独立しお考えるこずができたす。たたは、関心ず評䟡の競合の可胜性を考慮しお組み合わせるこずができたす。



評䟡



すべおの登録ナヌザヌが評䟡されたす。評䟡は、他のゞャヌナルを含む蚘事、レビュヌ、コメントに察しお取埗されたす。理想的には、評䟡は半自動である必芁がありたす。



すべおのナヌザヌアクションがログに蚘録され、アクションごずにナヌザヌの評䟡を増枛できるこずが重芁です。たずえば、レビュヌ担圓者はレビュヌごずにポむントを受け取りたす。レビュヌに偏りがあるこずが刀明した堎合、たたは明らかな間違いを芋逃した堎合、レビュヌ担圓者は評䟡にマむナスを受け取りたす。良いレビュヌのために远加のポむントプラスを受け取りたす。蚘事を評䟡するずきに発生する物議を醞すケヌスがどのように扱われるかを以䞋に説明したす。



コメント 



レビュヌずそれに察する著者の回答は、コメントの最初のレベルになりたす。同時に、レビュヌ担圓者は匿名のたたにするこずも、自由に名前を開くこずもできたす。



すべおの登録ナヌザヌは、任意の蚘事にコメントを残すこずができたす。これらは、「ナヌザヌ」レビュヌ、無料のディスカッションスレッド、実隓の再珟成功ず倱敗の䞡方、䞍十分な詳现な方法に関する苊情、および利甚できないデヌタである可胜性がありたす。



このような苊情は半自動で行うこずができたす。ボタンをクリックしお苊情の本質を説明するこずで、苊情を残すこずができたす。䜜者はそのような間違いを自分で蚂正するこずができ、そうすれば圌らの評䟡は䞋がらない。著者が苊情に応答しない堎合、远加のレビュヌアが割り圓おられ、蚘事の著者ず元のレビュヌアは評䟡を倱いたす。



個々の実隓を含むコメントは、独自のIDdoiを受け取り、レビュヌ担圓者がレビュヌできたす。著者は、コメントの圢で蚘事に远加の実隓を投皿するこずもできたす。蚘事の行に合わない実隓は通垞原皿に含たれないので、これはしばしば圹に立ちたす。この機䌚を利甚すれば、本栌的な出版物に匕きずられるこずなく、蚘事に基づいた小さな䜜業を行うこずができたす。たずえば、これは孊生のプロゞェクトに圹立ちたす。



ネット



このバヌゞョンのサヌビスでは、倚数のナヌザヌがいるネットワヌクを最倧限に掻甚できたす。たずえば、同じ怜玢履歎を持぀ナヌザヌが読んだ蚘事の掚奚事項を取埗できたす。



たたは、有名な科孊者に登録しおください。そしお、圌の蚘事の評䟡を䜿甚するこずによっおのみ、出版された䜜品に察する圌の意芋の䞀郚を埗るこずができたす。぀たり、各科孊者はある意味で線集者になりたすが、公開前ではなく公開埌に蚘事を遞択したす。



さらに、そのような盞互䜜甚のネットワヌクは、関心のある察立を芋぀けるこずを可胜にしたす。



玛争解決



どのシステムでも競合が発生する可胜性があるこずは明らかです。これは、りィキペディアや他のリ゜ヌスでの線集戊争の䟋で芋るこずができたす。アルゎリズムを䜿甚しお競合を識別および解決できたすが、堎合によっおは人間による決定が必芁になりたす。モデレヌタヌは、恒久的に䜜業するこずも、ボランティアになるこずもできたす。 2番目のケヌスでは、評䟡の高いアクティブナヌザヌが、特定の蚘事やコメントを確認するように求めるメッセヌゞを受け取る堎合がありたす。぀たり、レビュヌ担圓者ずしお機胜できたすが、特定の問題に察凊するためです。



倚くの堎合、競合の怜玢は自動化できたす。いく぀かの兞型的な朜圚的な敎合性違反が考慮される堎合がありたす。



反察の孊校-耇数のグルヌプが異なる理論を持ち、反察の芖点を栌䞋げしようずする堎合がありたす。 



この状況は、リンクのグラフ匕甚、評䟡、所属によっお刀断できたす。反察のグルヌプはグラフ内の孀立したクリックで衚され、互いの蚘事のスコアは反察になりたす。この堎合、別のグルヌプの成瞟、コメント、レビュヌに特別なラベルを付けるこずができたす。それらを捚おるだけでなく、貎重な情報を含めるこずができたす。しかし、そのようなレビュヌも公平であるず芋なすこずはできたせん。



「友達」 -時には逆の状況が起こり、同僚や知人はお互いを過倧評䟡したす。これは、リンクず匕甚のグラフから蚈算するこずもできたす。このような評䟡には、特別なタグを付けるこずもできたす。



苊情..。コメントに぀いおのセクションですでに曞いたように、蚘事に重倧な欠陥を芋぀けた堎合は、蚘事に぀いお文句を蚀うこずができたす。これは、メ゜ッドの詳现な説明が䞍十分であるか、コヌドたたはデヌタ参照が欠萜しおいるか、より深刻な問題画像の操䜜、改ざん、たたは疑䌌科孊理論がある可胜性がありたす。小さな苊情は、モデレヌタヌを介さずに䜜成者が修正できたす。重倧な違反は、決定を䞋す独立したモデレヌタヌたたは耇数によっお凊理されたす。この決定に応じお、著者、レビュヌア、コメンテヌタヌの評䟡が倉わりたす。



プロモヌション



Darksnakeは、同様のシステムを説明し 、圌に解説最初の郚分に。圌はたた、そのような雑誌を宣䌝する方法に぀いおのアむデアを共有したした。

たさにプレプリントアヌカむブずしお。珟圚、それらはほずんどありたせん。プレプリントのアヌカむブに基づいお、正匏なゞャヌナルを䜜成できたす。自分の雑誌を䞀から䜜るのは珟実的ではありたせん。しかし、既成の出版物に基づいお雑誌を䜜成するこずは非垞に珟実的です。


このようなプロモヌションモデルは、説明したシステムにも適しおいるように思われたす。実際、ナヌザヌの芳点からは、プレプリントアヌカむブず倧差ありたせん。この堎合も、線集スタッフに远加費甚はかかりたせん。



ちょっずしたファンタゞヌ
, — . , . — , . , .



PubMed Central (PMC). — National Institutes of Health (NIH) — , NIH, . , PMC.



レビュヌアの仕事に察する支払い 



読者ず著者の䞡方のための無料サヌビスオプションに぀いお説明したした。もちろん、むンフラやその他の必芁な費甚を維持・開発するには、ある皋床の金額が必芁です。ただし、プレプリントサヌビスの䟡栌で、ピアレビュヌされたゞャヌナルを入手できたす。



将来的には、レビュヌ担圓者の報酬を远加できたす。たずえば、レビュヌごずに100〜200ナヌロです。それでも、著者の総コストは、オヌプンアクセス出版物の平均コストよりもはるかに䜎くなりたす。さたざたなオプションがありたす。レビュヌ担圓者は、レビュヌの品質ず評䟡に基づいお支払いを受けるこずができたす。雑誌に掲茉するための支払いは、「できる限り支払う」スキヌムたたはその他のスキヌムに埓うこずができたすが、いずれにせよ、珟圚のオヌプンアクセスコストよりもはるかに少ない金額です。



問題



このシステムの議論で、私はいく぀かの朜圚的な問題に遭遇したした。それらのいく぀かに぀いお議論したしょうコメントにはもっずあるず確信しおいたす。



レビュヌアの䜜業負荷が倧きすぎる



線集者が事前に遞択しないず、レビュヌアに提出される蚘事が倚すぎるこずが懞念されたす。これは解決可胜な問題のように思えたす。



たず、各レビュヌアに送信された蚘事の数を远跡するのは簡単で、すでに蚘事が倚すぎる堎合は新しい蚘事を送信したせん。



第二に、通垞レビュヌのために蚘事を送られない科孊者のかなり倧きな予備がありたす-postdocsず倧孊院生。倚くの堎合、圌らはあたりクヌルではないゞャヌナルの蚘事をレビュヌする人ですが、正匏には蚘事のレビュヌ担圓者ず芋なされおいる䞊叞からオファヌを受け取りたす。倚くの人は、キャリアの早い段階で科孊者によるピアレビュヌに懐疑的ですが、圌らの倚くは、幎配の同僚ず同様に、このタスクに察凊できるようです。



第䞉に、私の経隓では、すべおのレビュヌ担圓者がレビュヌのために投皿する前に蚘事を完党に読むわけではありたせん。この堎合、朜圚的な査読者自身が芁玄を読んで写真を芋るこずによっお蚘事をずるかどうかを決めるこずができたす。レビュヌアは、蚘事に興味がない堎合、必芁な分野で十分な胜力があるず考えおいない堎合、たたは時間がない堎合は、い぀でも蚘事の受け入れを拒吊できたす。



第四に、評䟡システムはこの問題の解決に圹立぀はずです。したがっお、より高い評䟡を持぀科孊者は、レビュヌアを芋぀ける際に利点を埗るこずができたす。たた、匿名の通信でも評䟡を衚瀺できたす。逆に、評䟡の䜎いナヌザヌは、品質の䜎いデヌタの送信に以前気づいおいたため、蚘事を送信する胜力が制限されたすたずえば、数か月に1回以䞋。



「いいね」の蚘事をシャヌプにする



これは、科孊者が導入された評䟡システムに可胜な限り蚘事を調敎するこずを意味したす。たた、他の科孊者からの条件付きの「いいね」で蚘事を評䟡するこずを提案した堎合、蚘事はこれらのいいねをより倚く取埗するように最適化されたす。これは、あらゆる評䟡システムで発生する氞続的な問題です。で解説前回の蚘事で、jungeschwiliは述べたコブラの効果ずグッドハヌトの法則非垞によく問題を説明し、。それにもかかわらず、この圱響を補償するためにいく぀かの方法を提案するこずができたす。



たず、評䟡は蚘事の品質の唯䞀の尺床ずなるこずを意図したものではありたせん。私は、圱響芁因の評䟡から離れるこずだけを提案し、レビュヌアの明癜な評䟡も远加したす。



第二に、関心のある競合を自動的に怜玢するこずで、䜜者の「友達」や「敵」からの「いいね」の目立ったシェアを回避できたす。これはあたり客芳的ではないかもしれたせん。



第䞉に、フィヌドバックを埗るのが最適です。科孊者が蚘事を䞍誠実に評䟡するず、評䟡の䟡栌が䞋がりたす。



もっず深くする必芁がありたす



マむクロアヌティクル



この点の前提ずなる問題は、前回は分析したせんでした。それは、蚘事のすべおの著者を評䟡する方法で構成されおいたす。生物孊では、最初の著者が最も重芁であるず考えられおおり、圌はその仕事に最倧の貢献をしたした。しかし、グラデヌションが倚く、参加の床合いを倚数の䜜者に分けるのは難しい堎合がありたす。䞀郚のゞャヌナルは、蚘事の最埌に著者の貢献を盎接瀺すように求めおいたす。



ただし、もっず興味深い解決策がありたす。蚘事が単䞀の党䜓ずしおではなく、䞀連の個別の実隓ずしお公開されおいる堎合は、それぞれに個別の䜜成者リストを䞎えるこずができたす。たた、蚘事党䜓を匕甚するこずはできたせんが、興味のある郚分だけを匕甚するこずができたす。



この抂念には倚くの興味深い利点がありたす。 Petr Lidskyは、この蚘事で抂念ずそれに移行するプロセスに぀いおも詳现に説明したした。..。将来の雑誌の開発のためのオプションの1぀を怜蚎するこずに興味がある堎合は、よく理解しおおくこずを匷くお勧めしたす。



受信した情報の統合



最も重芁な問題の1぀は、科孊蚘事、䞀般的な科孊知識の線成をどのように公開するのが最善かずいうこずですらありたせん。結局のずころ、各蚘事は、図なしで組み立おようずしおいる巚倧なパズルのほんの䞀郚にすぎたせん。



レビュヌは珟圚、異皮の研究を組み合わせる数少ない方法の1぀です。科孊者は様々な実隓的研究に基づいおそれらを曞きたす。ただし、最高のレビュヌでさえ、すぐに叀くなり、毎週新しい蚘事が出おきたす。



コメントで1、2コミュニティによるレビュヌの曎新を維持するためにwiki圢匏を䜿甚するこずを提案した前の蚘事に。私の意芋では、これはかなり興味深いアむデアです。さらに、さたざたなデヌタベヌスでわずかに異なるバヌゞョンですでに䜿甚されおいたす。ただし、ここにも開発の䜙地がありたす。



これは私の同僚であるZoyaChervontsevaが科孊出版物の問題に関する圌女の芋解を説明する方法です。

珟圚の生物孊的出版物の最倧の問題は、組織的な郚分ではなく、意味的な郚分の混乱であるように私には思えたす。互いに盞関関係のない倚くの私的な声明がありたすプロテむンAはこれを行い、そのような条件䞋でそれを行いたす。レビュヌはこのニヌズを満たそうずしたすが、䞍足しおいたす。出版物の理想的なシステムであるIMHOは、その新しいステヌトメントを以前の知識の構造グラフに明瀺的に曞き蟌む必芁がありたす。



別の難しさは、倚くのステヌトメントが珟圚確率的であるずいう事実にありたす-䜕かをするのはプロテむンAではありたせんが、おそらく私たちの新しい超掗緎されたプロトコルの結果によるず、プロテむンAはそのようなものであり、そのようなp倀はDNAのこのサむトに結合したす-そしおゲノム内の䜕千ものサむトに぀いおはこれだけです。぀たり、情報の単䜍ではなく、情報の確率密床であるこずがわかりたす。さらに、もちろん、分析プログラムのバッチ効果ずバグ-はい。しかし、ここでの再珟性は、原則ずしお、珟圚このタむプの情報を適切に統合できないずいう事実ほど悪くはないようです。


珟圚、さたざたなデヌタベヌスが同様の機胜を実行しおいたす。しかし、それらはただ理想からは皋遠いです。科孊の倧郚分を䞀床に蚘述するデヌタ構造を䜜成するこずは蚀うたでもありたせん。しかし、この方向性は近い将来掻発に発展しおいくず確信しおいたす。



将来の叀兞的な雑誌の圹割 



叀兞的な雑誌が䞀倜にしお消えるこずはないこずは明らかです。しかし、これは必芁ありたせん。それらは、オヌプンアクセスシステムず䞊行しお機胜する可胜性がありたす。



たずえば、著名な科孊者を遞び、さたざたな専門分野のレビュヌを䟝頌するこずができたす。たたは科孊ゞャヌナリズムをやっおいたす。たたは、専門家以倖の人に研究をより簡単に提瀺するこず。



少し結論



これらは、私にずっお有望な出版物の開発の方向性です。近い将来、そのような予枬でさえ、かなり控えめなものになる可胜性があるず思いたす。この分野での開発には倧きな可胜性があり、どの圢匏の情報提瀺が最も効果的かを誰が知っおいたすか。科孊的な出版物を䜜成し、利甚可胜な機䌚を利甚する必芁があるず確信しおいたす。



より倚くのフォヌマット、良いず異なる




そしお、この蚘事を読んでいただきありがずうございたす。コメントでのディスカッションにご招埅したす。おもしろいアむデアがあるず思いたすので、喜んでご盞談させおいただきたす。



謝蟞



この蚘事の議論ずアむデアを提䟛しおくれたOlgaZolotarevaに感謝したす。テキストのチェックに協力しおくれたSofyaKamalyanに感謝したす。蚘事の最初の郚分の議論に参加したすべおの人に感謝したす。特に、Peter Lidsky、Nadezhda Vorobyova、Omar Kantidze、Zoya Chervontseva、AlexeySavchikです。Habrナヌザヌの堎合rg_software、Jerf、CactusKnight、qvan、technic、darksnake、nnseva、damewigitなど。たた、科孊出版物の問題に぀いお話し合ったすべおの同僚にも。



蚘事の最初の郚分。



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